聚丙烯酰胺的用途之一是絮凝在液體中的固體，此過程适用於各種污水廢水處理。大多數聚丙烯酰胺是以液體形式提供作用的。

它可以生成高粘度水溶液濃度低的聚丙烯酰胺聚合物，聚丙烯酰胺及其衍生物的另一個常見用法是在地下水的淨化和應用，如提高採收率。

同樣
，作爲添加劑的粉狀及其共聚物的吸水性能，聚丙烯酰胺聚合物的離子形式在水處理行業中扮演著一個重要的角色，使水處理廠(chǎng)大大提高瞭(le)原水的總有機含量 (TOC)。 三氯化鐵和氯化鋁(lǚ)等三價(jià)金屬鹽都是由聚丙烯酰胺的聚合物相鏈和橋接。

聚丙烯酰胺在分子生物學中作爲一種媒介以電泳蛋白質和核酸的技術，利用與其他水處理藥劑的作用相結合下使用，結果絮凝率大幅度提高。

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